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Recherche structurée de littérature

Guide méthodologique

La plupart des bases de données biomédicales utilisent un vocabulaire contrôlé ou thésaurus. 

Thésaurus: définition 

Un thésaurus est un vocabulaire contrôlé relatif à un domaine. Il est régulièrement mis à jour. Les termes de ce vocabulaire contrôlé (aussi appelés descripteurs ou mots-sujets) sont attribués aux références par la base de données pour décrire le contenu de l'article.

Dans un thésaurus, les descripteurs sont regroupés en catégories et reliés entre eux hiérarchiquement:

  • Les termes situés à un niveau supérieur sont appelés descripteurs génériques
  • Les termes situés à un niveau inférieur sont appelés descripteurs spécifiques

 Il ne faut pas confondre ces descripteurs (ajoutés par la base de données) avec les mots-clés ou keywords présents dans l'abstract de la référence (choisis par les auteur-e-s de l'article), il s'agit de deux éléments bien distincts!

Utilité du vocabulaire contrôlé

L'utilisation de descripteurs dans les équations permet d'optimiser les recherches:

1. Recherche en une seule fois tous les synonymes de ce terme

Un descripteur est utilisé pour catégoriser tous les articles utilisant ses synonymes. Sur PubMed par exemple, les articles utilisant à choix les expressions passive smoking, tobacco smoke pullution, secondhand smoking, involuntary smoking auront tous reçu le même descripteur ("Tobacco Smoke Pollution"[Mesh]) car le vocabulaire contrôlé identifie ces expressions comme des synonymes de ce descripteur.


2. Elargit la recherche aux descripteurs spécifiques situés plus bas dans la hiérarchie sans avoir à tous les indiquer dans l'équation

Dans Embase, une recherche avec le descripteur 'Phototherapy'/exp permet d'élargir la recherche aux photothérapies plus spécifiques comme color therapy, heliotherapy, etc.


3. Lève l'ambiguïté qui peut exister sur certains mots du langage naturel

Vous cherchez des articles sur le Sida. Une recherche standard avec le mot AIDS trouve des articles sur AIDS virus, mais aussi de nombreux articles sur des sujets comme clinical aids, nurses aids, teaching aids etc. Une recherche avec le descripteur MeSH : Acquired Immunodeficiency Syndrome [MeSH] limitera la recherche aux articles sur le sujet.

Remarques

Syntaxe spécifique à chaque base de données

L'utilisation des descripteurs dans les équations de recherche est soumise à des règles de syntaxe, qui doivent être respectées pour que la base de données comprenne que l'on recherche un descripteur. Ces règles de syntaxe sont spécifiques à chaque base de données.

Exemple pour le concept de passive smoking
Dans PubMed, le descripteur MeSH est "Tobacco Smoke Pollution"[Mesh]
Dans Medline Ovid, le descripteur MeSH est Tobacco Smoke Pollution/
Dans Embase, le descripteur Emtree est 'Passive Smoking'/exp
Dans CINAHL, le descripteur CINAHL est (MH "Passive Smoking")

 

Bon à savoir

- Certains sujets ne peuvent pas être exprimés avec un seul descripteur et nécessitent l'association de deux descripteurs

Pour le sujet de community-acquired pneumonia, dans PubMed il faudra associer deux descripteurs MeSH : "Community-Acquired Infections"[Mesh] AND "Pneumonia"[Mesh]


- Il est possible d'ajouter plusieurs descripteurs pour un concept-clé dans le tableau de vocabulaire. A l'inverse, il arrive qu'il n'existe aucun descripteur et que seuls des termes libres soient ajoutés et utilisés

- Dans les bases de données sans thésaurus (Cochrane CENTRAL, Web of Science), l'interrogation se fait en termes libres uniquement 

Traduction française du vocabulaire MeSH

HeTOP est un portail terminologique contenant la traduction française des descripteurs MeSH. Cet outil peut vous aider, à partir du concept-clé en français, à trouver le terme anglais utilisé dans le vocabulaire MeSH.

  1. Sur hetop.eu, entrez le terme de recherche. Utilisez des mots simples, évitez les expressions
  2. Cliquez sur le terme adéquat dans la liste de candidats
  3. Observez le terme indiqué sous Libellé préféré. Lisez la définition pour vous assurer qu'il correspond au concept d'intérêt
  4. Sur PubMed, accédez au Mesh Database (répertoire contrôlé des descripteurs MeSH)
  5. Dans la barre de recherche, utilisez le terme identifié préalablement sous Libellé préféré
  6. Observez la notice du descripteur: vérifiez la définition, la date d'ajout, la hiérarchie
  7. Cliquez sur Add to search builder pour obtenir sa syntaxe exacte
  8. Copiez-collez la syntaxe obtenue dans votre tableau de vocabulaire

Il s'agit d'un portail terminologique de santé, tous les concepts ne pourront pas être traduits. Pour les termes ne faisant pas partie du vocabulaire biomédical, nous préconisons l'utilisation du traducteur en ligne DeepL.