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Recherche structurée de littérature

Guide méthodologique


La construction d'équations de recherche est un processus itératif qui demande des ajustements et des modifications selon les résultats obtenus. Tester les équations permet d'évaluer la pertinence des modifications apportées à une équation.

Deux types de tests sont réalisables:

Ces tests se font à partir de l'historique des recherches, accessible en cliquant sur Advanced en-dessous de la barre de recherche.

Vérifier la présence des articles d'intérêt dans les résultats

Pour vérifier la qualité de votre équation de recherche structurée, regardez si elle permet de retrouver les articles identifiés dans votre Gold Set.

1. Identifiez les PMID (identifiants PubMed) des articles du Gold Set et listez-les avec un espace entre chacun. Enregistrez cette liste dans votre document pour pouvoir la réutiliser.
 Où trouver le PMID d'un article?

PMID PMID PMID
28903579 24028260 20836610 20230134


2.  Recherchez cette liste dans PubMed. La liste de vos articles d'intérêt s'affiche sur la page des résultats

3. Ouvrez l'historique des recherches et repérez le numéro (#) attribué aux lignes correspondantes

4. Dans la Query box, en adaptant l'équation avec les numéros de lignes de votre historique, inscrivez l'équation suivante et lancez la recherche:

#liste de PMID NOT #équation à tester

5. Observez les résultats du test:

  • Si aucun résultat ne s'affiche (No results were found): félicitations! Tous les articles d'intérêt de votre Gold Set sont trouvés parmi les résultats de votre équation de recherche
     
  • Si des résultats s'affichent, cela signifie que ces articles ne sont pas trouvés avec votre équation. Essayez de comprendre pourquoi ils ne sont pas retrouvés. Y-a-t-il dans la référence de ces articles des termes MeSH (ou des termes libres au niveau du titre et de l'abstract) que vous n'avez pas employés et qui seraient pertinents pour compléter votre recherche? Avez-vous ajouté des filtres ou limites qui excluent ces articles? Tous les concepts de votre équation sont-ils présents dans l'article ?

Exemple

Tester l'ajout/retrait d'un terme

Lorsque vous identifiez de nouveaux descripteurs ou termes libres, il est intéressant d'observer les résultats additionnels obtenus grâce à l'ajout de ces termes dans votre équation. A l'inverse, quand vous avez un doute sur un terme utilisé, il est intéressant d'observer les références exclues si on retire ce terme.

1. Recherchez votre équation de base sur PubMed

2. Dans votre document de traitement de texte, copiez votre équation de base, ajoutez ou retirez le terme à tester afin d'avoir une nouvelle équation.

3. Recherchez votre nouvelle équation sur PubMed. Observez les résultats:

  • Si le nombre de résultats n'a pas changé, vous pouvez valider les changements et stopper ici le processus de test. Votre équation modifiée est désormais votre équation de base.
     
  • Si le nombre de résultats a changé, suivez les étapes ci-dessous pour identifier quelles sont les références supplémentaires ou celles qui ne sont plus retrouvées.

4. Ouvrez l'historique des recherches et repérez le numéro (#) attribué aux deux équations à comparer


5. Dans la Query Box, en adaptant l'équation avec les numéros de lignes de votre historique, inscrivez l'équation suivante et lancez la recherche:

#équation avec plus de résultats NOT #équation avec moins de résultats

6. Observez les résultats du test:

  • En cas d'ajout d'un terme, les résultats qui s'affichent sont les nouvelles références trouvées grâce à l'ajout du terme testé.
    Observez ces nouveaux articles. Sont-ils pertinents? Ce terme amène-t-il des résultats hors sujet? Si les résultats semblent intéressants, assurez-vous d'ajouter le nouveau terme au tableau de vocabulaire et d'utiliser dorénavant votre nouvelle équation enrichie avec ce terme.
     
  • En cas de retrait d'un terme, les résultats qui s'affichent sont les références exclues, qui ne sont plus retrouvées avec la suppression de ce terme de l'équation. Observez ces articles:
    • Sont-ils bien hors sujet? Dans ce cas, le terme peut effectivement être retiré de l'équation. Retirez le aussi du tableau de vocabulaire.
    • Certains articles sont pertinents? Dans ce cas, vous ne pouvez pas retirer ce terme.

Exemple: test après ajout d'un terme

Vous avez identifié le descripteur "Cardiovascular System"[Mesh] et souhaitez voir quels articles supplémentaires sont trouvés si vous ajoutez ce terme à votre équation.